Потенциал этого полигона постоянно скачет и, может, будут создаваться помехи на всём вокруг?
Будут, конечно, как же без них... Если они вам критичны (всяко бывает, в одном из устройств моей разработки из-за 4-сантиметрового проводничка случилась проблема при сертификации на ЭМС, ну пока прошло - помеха была ровно по границе нормы), то придётся его прятать - например, за металлический корпус. Или ещё как-то снижать уровень помехи. А если нет - то и забейте на неё.
или по основному питанию я тоже не верно действую?
По основному вопросов нет. По аналоговому - теперь тоже нет. (Я даже не знал, что это было именно аналоговое питание, просто не стал смотреть.)
Большой электролит не сгладит питание для 7805? Если нет, то можно ли просто увеличить номинал керамического конденсатора, того который рядом со стабилизатором? Если можно, то до какого номинала?
Я к 7805 и другим интегральным стабилизаторам электролиты ни на вход, ни на выход вообще не ставлю без крайней необходимости. Стараюсь ставить электролиты только там, где без них никак не обойтись. К 7805 достаточно на вход и выход по одной микрофараде, и проблем уже (при правильной разводке платы, конечно) не должно быть.
Фильтры на оба входа датчика тока так должны выглядеть?
Оба конденсатора 100 нФ я бы повернул на 180 градусов, так и разводка проще будет, и земли лучше лягут. А то у вас к правому длинная сопля тянется.