Получается что если в прошивке реализовано подобное по "опросу" светодиода, то по идее прошивка может перестать работать корректно ?
Мы не видим всю схему! Может линия питания к МК идёт через катушку (антенну), и коммутируя питание на светодиодах, ПО таким образом меняет свой ток потребления и осуществляет передачу данных радиоволнами, генерируемыми в антенне! Может коммутация свечения светодиода промодулирована ЧМ- или ФМ-модулированным сигналом.
А забрав лампочки у МК, вы загубите эту функцию.